Амидаза (AMD)
Ферменттер:Макромолекулалық биологиялық катализаторлар, ферменттердің көпшілігі белоктар
Амидаза:Бос қышқылдар мен аммиак алу арқылы ацил тобын суға көшіру арқылы әртүрлі эндогендік және бөгде алифатты және ароматты амидтердің гидролизін катализдеңіз.Гидроксамин қышқылдары және басқа органикалық қышқылдар дәрілік заттар ретінде кеңінен қолданылады, өйткені олар өсу факторларының, антибиотиктердің және ісік тежегіштерінің құрамдас бөлігі болып табылады.Амидазаларды катализатор стереоселективтілігіне сәйкес R типті және S типті ацилазаларға бөлуге болады.
Амидаза амидтердің гидролизін катализдеумен қатар, гидроксиламин сияқты қосалқы субстраттардың қатысуымен ацилді тасымалдау реакцияларын катализдей алады.
Әртүрлі көздері бар амидазаның субстрат спецификасы әртүрлі, олардың кейбіреулері тек ароматты амидтерді, кейбіреулері тек алифатты амидтерді, ал кейбіреулері α- немесе ω-аминамидтерді гидролиздей алады.Аминдердің көпшілігі тек ациклді немесе қарапайым ароматты амидтер үшін жақсы каталитикалық белсенділікке ие, бірақ күрделі ароматтылар үшін гетероциклді амидтер, әсіресе орто алмастырғыштары бар амидтер, әдетте, белсенділігі төмен (тек бірнеше ферменттер жақсы каталитикалық әсер көрсетеді).
Каталитикалық механизм:
| Ферменттер | Өнім коды | Өнім коды |
| Фермент ұнтағы | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 амидаза жиынтығы, әрқайсысы 50 мг 19 элемент * 50 мг / элемент немесе басқа мөлшер |
| Скрининг жинағы (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 амидаза жиынтығы, әрқайсысы 1 мг 19 элемент * 1 мг / элемент |
★ Жоғары субстрат ерекшелігі.
★ Күшті хиральды селективтілік.
★ Жоғары түрлендіру тиімділігі.
★ Жанама өнімдер аз.
★ Жеңіл реакция жағдайлары.
★ Экологиялық таза.
➢ Фермент скринингін субстрат ерекшелігіне байланысты арнайы субстраттар үшін жүргізу керек және ең жақсы каталитикалық әсері бар мақсатты субстратты катализдейтін ферментті алу керек.
➢ Ешқашан төтенше жағдайлармен байланыспаңыз, мысалы: жоғары температура, жоғары/төмен рН және жоғары концентрациясы бар органикалық еріткіш.
➢ Әдетте реакция жүйесінде субстрат, буфер ерітіндісі болуы керек (ферменттің оңтайлы реакция рН).Гидроксиламин сияқты қосалқы субстраттар ацил беру реакциясы жүйесінде болуы керек.
➢ AMD оңтайлы реакция рН және температурасы бар реакция жүйесіне соңғы рет қосылуы керек.
➢ AMD барлық түрлерінде әртүрлі оптималды реакция жағдайлары бар, сондықтан олардың әрқайсысын жеке-жеке зерттеу керек.
1-мысал(1):
Әртүрлі амидтік субстраттарға гидролиз белсенділігі
| Субстрат | Арнайы әрекет мкмоль мин-1mg-1 | Субстрат | Арнайы әрекет мкмоль мин-1mg-1 |
| Ацетамид | 3.8 | ο- OH бензамид | 1.4 |
| Пропионамид | 3.9 | p- OH бензамид | 1.2 |
| Лактамид | 12.8 | ο-НХ2бензамид | 1.0 |
| Бутирамид | 11.9 | p-НХ2бензамид | 0,8 |
| Изобутирамид | 26.2 | ο-Толуамид | 0.3 |
| Пентанамид | 22.0 | p-Толуамид | 8.1 |
| Гексанамид | 6.4 | Никотинамид | 1.7 |
| Циклогексанамид | 19.5 | Изоникотинамид | 1.8 |
| Акриламид | 10.2 | Пиколинамид | 2.1 |
| Метакриламид | 3.5 | 3-фенилпропионамид | 7.6 |
| Пролинамид | 3.4 | Индол-3-ацетамид | 1.9 |
| Бензамид | 6.8 |
Реакция 50 мМ натрий фосфатының буферлік ерітіндісінде, рН 7,5, 70 ℃ температурада жүргізілді.
| Амидтер | Гидроксиламин | Гидразин |
| Ацетамид | 8.4 | 1.4 |
| Пропионамид | 18.4 | 3.0 |
| Изобутирамид | 25.0 | 22.7 |
| Бензамид | 9.2 | 6.1 |
Реакция 50 мМ натрий фосфатының буферлік ерітіндісінде, рН 7,5, 70 ℃ температурада жүргізілді.
Байланысты реагент концентрациясы: амидтер, 100 мМ(бензамид, 10 мМ);гидроксиламин және гидразин, 400 мМ;фермент 0,9 мкм.
2-мысал(2):
3-мысал(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Экстремофильдер, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR және т.б.Процесс биохимиясы, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Чжэн RC, Jin JQ, Wu ZM және т.б.Биоорганикалық химия, 2017, Интернетте қол жетімді 7.
